Николай Райнов родился в селе Кесарево Велико-Тырновского района 1 января 1889 года в семье Ивана Райнова, македонского болгарина и национально-освободительного деятеля. Его братья — художник Стоян Райнов и писатель Богомил Райнов.
Он вырос в бедной и глубоко религиозной семье. Отец видит в нем будущего священнослужителя, поэтому настаивает, чтобы Николай поступил в духовную семинарию. Это во многом определяет его путь в жизни. Окончил Духовную семинарию в Софии (1908). Начал изучать философию в Софийском университете (1911).